カスタマインでカスタマイズを作成した後に、kintoneアプリにフィールドを追加した場合、そのままではカスタマインのフィールド選択ダイアログには表示されません。
この時、フィールド選択ダイアログの左上のリロードボタン（青色の円形矢印）をクリックすると、クリック時点でのフィールド構成を改めて取得し直すことができます。
クリックしてリロードが終わると、最新のフィールド構成が読み込まれて追加したフィールドが表示されます。
また、フィールド名やフィールドコードを変更したときも同様に最新化できますので、取得し直してみてください。
メイン画面に関するご説明も併せてご覧ください。