kintoneカスタマイズ、Job Runnerともに自動的に実行することは不可能ですが、kintoneカスタマイズで、kintoneの画面にボタンを設置し、ボタンを押すことで、Job RunnerのJobを起動して処理を行うことは可能です。例えばこちらの記事を参考にしてみてください。Job Runner版:CSVファイルから読み込んだレコードにまとめて自動採番