いいえ、Job RunnerにてCSVファイルやエクセルファイルからのkintoneへのデータ読み込み時において、処理を自動的に実行することはできません。

なお、kintoneアプリのカスタマイズでもそういった処理を自動で実行させる事はできません。

kintoneアプリのカスタマイズについての記事として kintoneにCSVやExcelファイルを読み込んだ時に画面のカスタマイズで設定したアクションや「やること」を実行できますか？ もございますので併せてご覧ください。

これらの制約はkintoneの仕様によるものです。

代替案となりますが、kintoneカスタマイズでkintoneの画面にボタンを設置し、ボタンを押すことでJob RunnerのJobを起動して処理を行うことは可能です。

例えばこちらの記事を参考にしてみてください。

Job Runner版：CSVファイルから読み込んだレコードにまとめて自動採番

他にも、定期的にJob Runnerの定期実行タスクを動作させ、対象となるレコードに対して一括で処理を行うといった方法も可能です。

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また、Customineドキュメントやサポートページもぜひご活用ください。